Zarząd Morskich Portów Szczecin i Świnoujście S.A. nie posiada instalacji, których eksploatacja wymagałaby uzyskania pozwolenia na emisję lub pozwolenia zintegrowanego.

Eksploatowane obecnie instalacje zgodnie z ustawą Prawo ochrony środowiska (Dz. U. z 2008r. nr 25 poz.150) zostały zgłoszone do Urzędu Marszałkowskiego Województwa Zachodniopomorskiego. W okresach półrocznych informacje w zakresie emisji gazów i pyłów, przekazane są do Urzędu Marszałkowskiego Województwa Zachodniopomorskiego oraz Wojewódzkiego Inspektora Ochrony Środowiska. Zgodnie z przepisami ustawy o systemie zarządzania emisjami gazów cieplarnianych i innych substancji (Dz.U. z 2009 nr 130 poz. 1070), emisja gazów i pyłów do atmosfery jest również przekazywana do Krajowego Ośrodka Bilansowania i Zarządzania Emisjami (KOBiZE).